Accession
slr0366
Plasmid made
yes
Plasmid info
one nt insertion in slr0364 (left flank)
Mutant made
yes
Mutant segregated
yes
Mutant info
expression is decreased by ntcA overexpression (nitrogen-replete conditions)
Gene Homology
Ig-like domain, DUF4114 (multiple), Ca2+-stabilized adhesin repeat, S (surface)-layer proteins similar to Pseudoalteromonas tunicata Slr4, Herpes virus major outer envelope glycoprotein (BLLF1)
Gene ID
[empty]
CDS
GTGACCTTTAACGGCACGACCTATACCTTTGGGGAAAATCCTCAGCTAACAGTCAGTGGCAACAACTGGACCCTAGACCTCAGCGGTATCACCACCCCTCCAGGGGATTACGTCATCACTGCTGTCACCACTGACTTAGCTAACAACACCAGCCAAGCCACTCAAAACGTCACGATCGACACCACAGCACCCAATGCCAGCATCACACTGACATCCAACATCACAGCAGATGATGTCATCAATGCCGTCGAAGCCGGTCAGCTCATTCCGATCACCGGCACCGTCGGTGGCAACGTCAGAGCCGGTGACATTGTCACCCTCGCGATCGGTGGTCAAACCTTCACAGGAGCAGTCGCCAATGGTGGTACCTTCAGCATCGATGTTCCAGGTAGCGCCTTAGTCGCTGACCCTGACCGCACCATTCAGGCCAGCGTCACCACCACCGACCTAGCCGGTAACAGCACCACTGCTACCGACACGGAGAGTTATACCGTAGATACAACAGTGCCCGGAGCACCGATTGTCACGATTACGGAAGACGTCAACAATGACGGGCTAATTAGTGTCGGGGAATTGAGTGGGTTAGTGGATGTATCTATAGCTATACCAGGTGGTGTGGTAGCAGGGGATATCCTGACTATCAGCGATGGCACCACTCCCCAAACCATCGTCTTAACCGCCGCCCAAATCAACGCCGGAGTAGTAACCACCCAGGTAGCAGTACCCAACCCAGGTACTACTTTAACGGTGACCGCCTTTGTTACAGATATTGCCGGTAACCAAGGTACCAGTGGCCGTGATAGTGCCGTATTAGATACCACCGCTCCCGGAGCACCCACCGTAACGATTACGGAAGATACCAATAATGACGGCTTCATAAGTGCAGGGGAATTGAATGGCCTAGTAGATGTATCGATCGCCTTGCCCACTGGGTTAGTTGCTGGGGACACCCTGACCATTAGCGATGGCACCACTCCCCAGACCATTGTCCTCACCACCGCCCAAATCACCGCCGGAGTAGTAACCACCCAGGTAGCAGTACCCAACCCAGGTACTACTTTAACGGTGACCGCCTTTGTTACAGATATTGCCGGTAACCAAGGTCCCAGTGGCCGTGATAGTGCCGTATTAGATACCACCGCCCCCGAAGCACCGGTGGTCACGATCGCCGAAGATGCCAATAATGATGGCTTAATCAGTGCTGGGGAATTGAATGGCTTAGTAGATGTATTGATCGCCTTGCCCACTGGGTTAGTTGCTGGGGACACCCTGACCATTAGCGATGGCACCACTCCCCAGACCATTGTCCTCACCACCGCCCAAATCACCGCCGGAGTAGTAACCACCCAGGTAGCAGTACCCAACCCAGGTACTACTTTAACGGTGACCGCCTTTGTTACAGATATTGCCGGTAACCAAGGTCCCAGTGGCCGTGATAGTGCCGTATTAGATACCACCGCCCCCGAAGCACCGGTGGTCACGATCGCCGAAGATGCCAATAATGATGGCTTAATCAGTGCTGGGGAATTGAATGGCTTAGTAGATGTATTGATCGCCTTGCCCACTGGGTTAGTTGCTGGGGACACTCTGACCATTAGCGATGGCACCACTCCCCAAACCATCGTCTTAACCGCCGCCCAAATCAACGCCGGAGTAGTAACCACCCAGGTAGCAGTACCCGCCGAAGGTGCCACTTTAACGGTGAGTGCATTCATAACGGATAATACTGGGAACCAAGGTCCTGATGGCAGCGATAGTGCCGTATTAAACACCACAGCGCCTAATGCCGGCCCCCTGGACATCACTGACGCAACTGATACCGGCGCCGATGACTTGTTGAGCAGTAATGGTAACCCCGAACTGACTTTCACTGGTGAACCAGGATTAGAGATTGAGTTGCTTGGGCCTGATGGTAACCCTGTTGATCCCGATGCCTATGAAGTGGTAGAAACCCCCGGTGCCAACCCTGGTGACCCTTCCACCTACACAATCAAATTAATTGACGCTGATCCATCTGACCCAGATAGCGATCCGTTTGGAGACTTCTTCAATGGAGTTGTCACAGGGAACCCTGCCAACACTGGGGATGGAACCTACACCATCACAGCAACGGATAATGCAGGCAATACCAACGATGTAGGTCAATTTGAAATTGATACGACTTCTCCCGGTACTCCCAACAATGGCAATTCTCCTTTCAGTCCCCTGGACATCACTGACCCAACTGATACCGGTGCCGATGACTTGTTGAGTAGTGATGGTAACCCCGAACTGACTTTCACTGGTGAACCAGGATTAGAGATTGAGTTGCTTGGGTCTGATGGTAATTCTGTTGACCCCGATGCCTATGAAGTGCTAGAAACCCCCGGTGTAAACCCTGGTGACCCTTCCACCTACACAATCAAGTTAATTGACGCTGACCCATCTGACCCAGATAGCGATCCGTTTGGAGACTTCTTCAATGGCTCCCCCACAGGTAATGGGGCCAATACCGGCGATGGCATTTACACCATCACAGCAACGGATAATGCAGGTAATACCAACGATGTAGGTCAATTTGAAATTGATACGACTTCTCCCGGTACTCCCAACAATGGCAATTCTCCTTTCAGCCCCCTAGACATCACTGACGCAACTGATACCGGCGCCGATGACTTGTTGAGCGGTAATGGCAACCCCGAACTGACCTTTAGCGGTGAGTCAGGATTAGAGATTGAGTTGCTTGGGCCTGACGGTAATCCCGTCGATCCCGATGCCTATGAAGTGGTGGAAACTCCCGGTGCCAACCCTGGTGACCCTTCCACGTACACAATCAAATTAGTTGACGCTGACCCTGACCCATCTGACCCGGATAGCGATCCGTTTGGAGACTTCTTCAATGGAGTTGTCACAGGGAACCCTGCCAACACTGGGGATGGAACCTACACCATCACAGCAACGGATAATGCAGGCAATACCAACGATGTAGGCCAATTTGAAATTAAGACTAGTTCTCTAATTTCTATCAACGATGATCGGGGTACCGTTGTCATTGGCGATCTGGGTTTTGGCTCCATCAATGTCGATGTCTTAGCCAACGATCAGGGCTTGGGCATTCAGATCACCAACCTGACCCAACCTCTTAAAGGTACGGCGGTGCTGCGGGATAATGGCACCCCCAATAATTTCAGTGACGATTTCTTGACCTATCACATCCATGAAGAGTTATTGGATTTACGTTCAGCCACAGGGCCTGTACGCATAGATATCAGTGATATTTTCAGCAGTGCGAGCTACAACAATTCCGTCGGCTTCTATCAAGTTTTGGATCATTTTGGCACCATTCTTGATCCGGCTTCTGGGCGACTTTTAACCCCGGCAGATCTGGAATACAGAAATGTGGCCCTGGCCAGCGCCATTCCTGGGCTACAAATCAGTAAGGATAATCCAGTTCAGTCCATTGAACTACCTGGAGGCGGCATCTATGCTCCGTTCCTAACGTCTGACCAGGGTAACGGGCAAGTGAATCACTTCTTCGCCCTCATTGATGCCAATCCAGGTCAAGTGGACTATGTTCGTTTTGCCAATGGCACCTATAGCTTTGAAGATAGTGCCTTTGGCGATCGAGATTTCAATGATCTGCGATTTGCGGTCAATATTTTGCCCCAGGGAGGTTTCGTTCCCCCAGCCATTGGCCTCACCGCTAACGCGGGAGTTTTCACCGCCAATGGGCTCGTTGATCAATTTACCTACACCATCACCGATGTTAATGGGGATAATCGGACCGCTAGCGTTGCCATTGACAATCAGGAACATCTCAAATTCACCCTGCTGGGAGTGGACGGAGATTTCAAAAATGAGGTGGCTATTTTCAGGGTGGACGATCGCCAGGGAACTATCAATGGCATTGCCCCAGGACAAGCAGGCTATCTGGAAGCGGCCTTAAGCAATAGCCAGGTGATATTTACCGGTATCAGTGGACAGACTCAGCTTTTCGGTGAATCCCTGACCCGGACTATGGAAGAATTCAAAGTTAGTGATAGTTTTGGTTTCCTGTTAATCCAGAATAATTCCCTGGATATGGTGCTCAGAGAGCAGGCCGCCGGGGCCATATCCACTCCGGTTTTCTTCAGTCAGGCGATCGCCAATGGCAATCAAATCCAACAAATCCCGAGTAATGATGGTCAGGGGATAGTTGTTGCTTGGGAAGATATTGCCCAGGGAGGAGACGGGGACTTTAATGACTTTATCTTCCGGGTGGCAATGACAGACCAACCGGCTCCCTTGGGGACGCTCTACCAAGGGCAAGCTCAACAGGAGATCTTCGCTAATACGAGCAATCAAAACGTTCAAATCGGGGTTCAGATCGCCAGTGACTCTGCCTATGACAATACTGTTGGTTTCTACCTGGTTCAAAATGCCCAGGGCACGGTGCTGGATTACACCACCGGTCAACTGGTCAACCCCGGTGATGCCAACTATGCTGAAGTGGCGGTGCGGCAACGTCTTGCCCTTGGTTCCAACGGCCAACCCATTGGGGGGGAAATTCGCCCAGGGCAAATTATTGCTCCCTTCCTGATTTCCAATGGCACCGAAAATCAATTCCTGACGGTTAATCCTGTCAACCAGGCGATCGCCGCTGGCCCCGTTGCCTTCTTTAGCTACATCAATGCCAACCCCGATGGACTGGATCATTTCCGGTTACTGGCGGATAACACCTTTGGGGTGGAAGACATGTTAGGAGGAGGAGACTTTGACTACAACGACGTGGTCATTAAGTTGGATCAGAATCCTGTTAATCGGGAATTATTGGACCTGCGTTCCCTCAGTGGCTCCGTAAATCTTGGCATCAACGAAATCACCGGTGATGCTTCCTTTGGGCTCTCCGTTGGTTTTTATCGGGTGGAAAATCAGTTTGGTGCCATTGCGGACCCCCTGACGGGCCAACTGCTAAACCCTGGTGATGGCAACTATCAAGCCGTGGCGCTGCAAAATACTGCCGCCCAATTTACTGTTACCCC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CDS Length
5229 bp
Strand
Positive
Up flank
TAATCCAGACAACACTGGCGACGGCACCTACACCATCGTTGCAACCGATGCTGCCGGTAACAGTGTTGAAGTTGATGAGTTTGTCATTGACACCACTCCTCCCAACATTGCTATCACCGCTATCACAAACGACAGTGGCACCCCCGGCGACTTCATTACCAACGATCAAACCCTGATCTATAGCGGGACAACCGATGCCAATGCCACGGTGACAGTAACCCTCACCGACAGCAGCAACAACCCTGTCTTCACAGCCACCACCACCGCAGATGCCAATGGCAACTGGTCGCTAGACCGCACTGCCAACGAAACCTTAGCCGGAGGCACTTACACCCTCACGGCCAGCACAACGGATCTGGCTGGCAACACAACCACCGATACTCAAGCCATTCGCATTGAAACCAATGCACCAGGCATTGCCATCGCCAGCATCAGCACTGACAGCGGCATCCCCGGCGACTTTGTCACCAACGACCAAACCCTAGTCATTGCTGGAACCTGGACCAACCTGGATACCAACACCTTGGCA
Up flank length
529 bp
Down flank
GGGCGCTGATCAGGGTAAAAAGTGGCTCTGGATTTCCCCCGCCGGTGGGTCTAGGGCAGGGCAAATTTAAAGAAACTCTGGGGATTGGCTCCATTCCCCAGAAAAACCTTTAAGATGGGTGGGATCTTTGCACTCTGGACATTCCCGCCCCCGGCGATCGCCATGGGTAGGGGAAGCTTTTTTCCCCTGTTGCCGTCAATGGATTCCGTGAGTCCGGTTTACCTTTCCGCCGTCCCCCAGGTTTATGTTGCTGAGTATCTCCAACGTTTTCATCAAAAACCCCGTGCTGACTACGGTGTGCACCATCGTGATCATCCTCCTCGGGGCGATCGCCTTACCCCTCCTGCCCCTGGCCAAACTTCCAGACATGGCCCCCAAACAGGTGCAGGTAACCACCAACTATGTGGGCTCCGATGCCCAAACTGCAGTGGATAATGTCACCACTGTGCTAGAGCGGCAGATTAACGGTACGGAGCAAGTCATTTATATGAACTCCACCACCGACAACACTGGCACTAGCACCATCAA
Down flank length
528 bp
Map (Benchling)
[empty]
Parts (SynBioHub)
[empty]
Uniprot search
Google Scholar search